Врз основа на Статутот на Клиниката и законските прописи, Управниот одбор носи интерни правилници кои овозможуваат непречено и организирано функционирање:
- Правилник за внатрешна организација - Овој акт ја утврдува структурата на Клиниката, поделена на сектори и оддели, со цел ефикасно вршење на дејноста. Организацијата вклучува медицински оддели (како оддели за дијабетес, ендокринологија, метаболни болести на коска) и административна служба (сектори за правни и финансиски работи). Целта е да се обезбеди сервисна ориентираност кон пациентите и меѓуодделенска координација.
- Правилник за систематизација на работните места - Со овој документ детално се опишани сите работни позиции, потребните квалификации, како и задачите за секое работно место – од раководни лица и субспецијалисти, до медицински сестри и технички персонал.
- Кодекс на деловно однесување - Го уредува професионалното однесување на вработените, со посебен акцент на чување на службена тајна и доверливост на податоците за здравствената состојба на пациентите.